方案在军事上的另一个重点是军力的调整。目前曹轩的第一军、昝万寿的第二军驻屯在汉中，张钰的第三军驻屯在夔州；石中树的第四军驻屯在善阐，负责云南、大理和交趾三省的防卫；董虎的山地师驻屯在川西，负责北至松州南至康定的蕃区防务；总参的直属师驻屯重庆，保护霹雳军总部的安全。按照方案提出的建议，第一、二、三军的部署不变，将第四军也调到汉中前线。为了弥补第四军北上之后的真空，将总参直属师的四个团外加上山地师抽调一个团，成立机动防御师，驻扎在善阐府。

抽调第四军北上，又让机动防御师南下，这让唐顺等非军方高层疑惑不解，觉得这种调兵方式太费解，毕竟千里迢迢路途也不平坦。除此之外他们也有些担心，毕竟总参直属师只有五个团，一下就抽走四个团，保卫总部的兵力就只有一个团了。对于于唐顺等人的迷惑，余柱笑着作了解释。虽然第四军同山地师和总参直属师一样，都是轻装部队，但第四军适合大规模野战，而山地师和直属师的作战则更为机动灵活，适合执行平叛及特种作战。在预备役部队和民兵的协助下，他们足以胜任云南、大理和交趾三省的防卫任务。

在海军方面的调整不大，北海舰队和海军陆战军仍驻扎在济州岛。眼下的济州岛已成为一座大军营，东海舰队驻扎在流求岛和小流求，南海舰队主力仍驻星岛，部分舰只驻扎在琼州岛，另有部分船只及舰队陆战团驻扎在澎湖岛。远在北方的鲜卑利亚大陆也有动作，库页城、黑龙城、伯力城、抚远城、海参崴等大城都有数百人的守备力量，小城也有几十上百人的守卫，北方公司将这些守备力量整合为一个三千人的加强团，又雇佣了二千生女真人士兵，编成了一个强悍的混成旅，只要一声令下便可往越过黑龙江南下。

战略方案讨论完之后，会议接下来研究了人事调整。虽然临阵换将乃是大忌，但霹雳军早就形成了成熟的管理制度，军队战力并不会因小调整而受到影响，再说按照欧阳轩估计，决战至少会在半年之后才会开始。会议通了欧阳轩提出的方案：石中树和董虎的职务对调，即董虎任第四军军长；石中树任机动防御师师长兼大理云南交趾守备，康定平叛有攻的顿珠任副师长。董虎作战风格大胆而犀利，擅攻而不擅守，而石中树性格沉稳谨慎，十分适合守家。在海军方面，夏大根出任东海舰队负责人，幕僚长一职由夏小根担任，其负责琼州岛一职，则由副总理鲁文安接任。黄大根不再兼任海军陆战军军长，改由陆战军骑兵师长吴青担任。袋鼠大陆的发现者钱虎则成了北方公司混成旅旅长。

对此次会议颇有微词的，只有欧阳轩的小舅子杨邦宪。在他看来，播州在此次会议上毫无存在感，实属白跑一趟。对此欧阳轩向他解释道，一方面播州虽与霹雳军关系特殊，但仍属盟友关系，协作抗蒙之事需要双方另行商议。另一方面，霹雳军与蒙元决战之时，也需要播州军护住后方。杨邦宪当然知道欧阳轩的意思，之所以没有调动播州军，是怕敌人偷袭侧翼。播州军有两个轻型步兵师，正好可以护住来自湖南和广西两个方向。